Van Hooff groeide op in Burgers’ Zoo in Arnhem, waar zijn vader en moeder directeuren waren. Van Hooff studeerde biologie in Utrecht en Oxford. Hij promoveerde op een onderzoek naar sociaal gedrag en communicatie bij mensapen. Van 1980 tot 2001 was hij hoogleraar ethologie en socio-ecologie aan de Universiteit Utrecht. Hier deed hij vooral studies naar het sociaal gedrag en de organisatie van dieren, in het bijzonder orang-oetans en chimpansees.
In recent onderzoek richtte hij zich op de socio-ecologie van enkele primatensoorten in veldwerkprojecten in Indonesië. Daarnaast bestudeerde hij de gevangenschapskolonies, onder andere in de chimpanseekolonie van Burgers’ Zoo. Daarbij ging het vooral om vragen als: Hoe gaan dieren die met elkaar in groepsverband samenleven om met conflicten en hoe lossen ze die op.
Momenteel is Van Hooff onder meer wetenschappelijk directiemedewerker van de Koninklijke Burgers’ Zoo te Arnhem. Hij was tot voor kort secretaris-generaal van de International Primatological Society en voorzitter van het Jane Goodall Instituut Nederland. Van Hooff presenteerde in de jaren zestig samen met zijn broer Zoo Zoo. Een maandelijkse show over dieren uitgezonden door de AVRO.
Van Hooff wil met zijn werk deze nieuwe ontwikkelingen in kaart brengen: de “ken- en denkwereld” van dieren met als achtergrond de ecologische selectiedrukken en de evolutionaire aanpassing. Dit alles behandelt hij ook in de cursus die hij voor de Martin Gaus Academie geeft, met bijzondere aandacht voor de hond.